一體化凈水器的工藝：原水→原水加壓泵→多介質過濾器→活性炭過濾器→軟水器→過濾器→1級反滲透→酸堿調節→中間水箱→2級反滲透→1級水箱→1級水泵→微孔過濾器→用水點一體化凈水器。是否能長期正常運轉很重要，需要定期維護一體化凈水器。
　　在使用一體化凈水器時，應注意以下事項：避免濾料進入反滲透裝置，選擇合適的濾料出水裝置，避免濾料漏砂和活性炭；選擇適當的活性炭，避免粉末脫落。
　　以自來水為水源的大型一體化凈水器，較好地配置了單獨供水系統，既可保障供水系統的穩定運行，又可減少啟停時反滲透系統對全廠供水網絡的瞬時影響。反滲裝置直接從原水管網取水，由于大部分水管網壓力波動大，需設置高低壓保護設施。
　　應考慮試劑與膜材料是否相容。舉例來說，混凝劑、助凝劑、還原劑和防垢劑在反滲透系統中經常同時使用。自然水中的膠體通常帶負電荷，所以通常使用陽離子型帶正電荷凝結劑。在R0裝置反滲透進水過程中，為避免水垢的產生，需要考慮到添加阻垢劑的措施，因為它們都帶有負電荷。一體化凈水器應避免陽離子凝結劑與陰離子阻垢劑發生反應，并避免反應產生的膠體化合物沉積在膜表面。